政府課錯稅，拿不出證據，還是無法拿回退稅。台北市稅捐處訂定退稅原則，決定從寬認定，只要稅捐機關或納稅人一方有直接或間接證據，證實確有溢繳稅款時即可退稅，財政部亦支持這項退稅原則。
稅捐處舉例，使用中的一般土地如被劃定為公共設施保留地後，依規定應按千分之六優惠稅率課徵地價稅，如果納稅人仍被按一般土地稅率從高課稅，事後經有關機關證明該地確已編定為公共設施保留地，稅捐機關自可依規定追溯辦理退稅。
稅捐稽徵法第28修正規定，自今（98）年1月21日生效後，課錯稅的案件，若可歸責為政府的錯誤，即不受退稅期限最長只有五年的限制。不過，若屬納稅人自行適用法令或計算錯誤，與政府無關者，退稅期限最長還是五年。
財政部指出，各稅捐機關在稅捐稽徵法第28條修正生效後，已陸續接獲納稅人主張政府課錯稅的申請退稅案件，為使稅捐機關退稅有一致原則，不管是納稅人或政府課錯稅，都要有證據才能退稅。
台北市稅捐稽徵處為此已訂定退稅原則，在受理民眾申請退還溢課稅捐時，需先釐清其溢繳稅款屬於納稅人本身或稽徵機關的錯誤後，再處理後續退稅事宜。
如屬政府課錯稅案件，台北市稅捐處規定，只要納稅人或稅捐機關任何一方，握有直接或間接證據足以證明溢課稅款，即不受五年退稅限制，稅捐處不但會退還納稅人的溢繳稅款，還會依規定加計利息退還。但退稅需舉證，包括：
一、雙方均有證據可以認定有溢繳稅款者。
二、稅捐處無證據，但納稅義務人有證據，且經查證認定有溢繳稅款者。
三、納稅義務人無證據，但稅捐處有證據，認定有溢繳稅款者。
四、雙方均無明確證據，但依經驗法則及稽徵作業一貫性，足以推定有溢繳稅款者，亦可退稅。
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